İntikamını zor ve kanlı yollardan alan bir katilin hikayesi
Sen Alex Mercer'sın, daha doğrusu Prototype denilen acımasız bir katilsin. Ancak bunun suçlusu sen değilsin, seni bu hale getirenler. Yeteneklerin bir insanın kulağına efsanevi ve güçlü gelebilir ancak sana göre sadece hafızanı...